Heart Stain kể về Woohyun, học sinh cuối cấp thầm thích giáo viên chủ nhiệm. Khi bạn thân Doha phát hiện bí mật, Doha bày tỏ tình cảm và đề nghị cả hai hẹn hò đến khi tốt nghiệp, khiến Woohyun phải đối diện với cảm xúc thật của mình.